一個(gè)持續(xù)100多年的謎題告破:生命為何能持續(xù)演化?
發(fā)布時(shí)間:2021-08-24
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100多年前,遺傳學(xué)家發(fā)現(xiàn)了生殖細(xì)胞中存在染色體重組的現(xiàn)象。這像是一種緩慢但平穩(wěn)的演化方式,通過(guò)每一代生物,讓基因組變得更具多樣性。但就算是一個(gè)堿基出現(xiàn)異常,也可能會(huì)導(dǎo)致疾病。直至近期,科學(xué)家才弄清楚生物是如何精確控制這個(gè)過(guò)程的。

撰文 | 石云雷

審校 | 吳非

有性生殖的優(yōu)勢(shì)

20世紀(jì)最有影響的遺傳學(xué)家之一、諾貝爾獎(jiǎng)獲得者赫爾曼·約瑟夫·馬勒(Hermann Joseph Muller)曾提出過(guò)一個(gè)理論,名為馬勒的齒輪(Muller's ratchet)。作為一個(gè)利用X射線研究基因突變的科學(xué)家,他表示有性生殖相比于無(wú)性生殖有一個(gè)很大的優(yōu)點(diǎn):有性生殖的生物在產(chǎn)生配子時(shí),會(huì)經(jīng)歷一個(gè)減數(shù)分裂的過(guò)程,這個(gè)過(guò)程能幫助生物修復(fù)嚴(yán)重的DNA損傷。

赫爾曼·約瑟夫·馬勒(圖片來(lái)源:諾貝爾獎(jiǎng)官網(wǎng))

在這個(gè)過(guò)程中,染色體會(huì)先復(fù)制一次,隨后細(xì)胞會(huì)分裂兩次,也就是一個(gè)母細(xì)胞最后會(huì)產(chǎn)生4個(gè)子細(xì)胞。在第一次分裂時(shí),母細(xì)胞中來(lái)自兩個(gè)親本的染色體會(huì)相互配對(duì),它們互為同源染色體。如果一條染色體存在雙鏈都受損的情況,染色體之間可以通過(guò)交換、重組來(lái)修復(fù)損傷。而在無(wú)性生殖的生物中,由于無(wú)法進(jìn)行重組,由DNA損傷等情況導(dǎo)致的基因突變會(huì)不斷累積,最終導(dǎo)致生物死亡。(當(dāng)然后期的研究證實(shí),一些采取無(wú)性生殖的生物如細(xì)菌,也能通過(guò)其他的方式來(lái)有效修復(fù)DNA損傷,因此馬勒的這一觀點(diǎn)可能并不正確。)

減數(shù)分裂時(shí),同源染色體之間會(huì)發(fā)生重組。(圖片來(lái)源:維基百科)

馬勒提出這個(gè)觀點(diǎn),與其師從的基因?qū)W說(shuō)建立者托馬斯·亨特·摩爾根(Thomas Hunt Morgan)利用果蠅開(kāi)展的遺傳學(xué)研究有關(guān)。在1916年,他還注意到在果蠅體內(nèi),具有相似的基因組成、能相互配對(duì)的染色體之間進(jìn)行片段交換,并不只是為了修復(fù)受損的基因,還能進(jìn)行基因重組,使得各個(gè)子代的基因組成并不相同。但是,科學(xué)界一直并不完全完全清楚基因重組產(chǎn)生的具體機(jī)制。

每一代都在演化

基因突變、基因重組都能促使物種演化。對(duì)細(xì)菌和病毒等來(lái)說(shuō),它們繁殖能力強(qiáng),在面對(duì)外界壓力時(shí),可以通過(guò)快速的基因突變來(lái)演化。經(jīng)過(guò)外界壓力的篩選,一個(gè)種群可能只遺留下少數(shù)突變株,但由于其高效的繁殖能力,這些突變株又迅速形成一個(gè)新種群。

多細(xì)胞生物體內(nèi)也存在基因突變,但對(duì)它們來(lái)說(shuō),通過(guò)突變來(lái)演化并不是一條十分合理、具有效率的途徑。例如,人體內(nèi)會(huì)通過(guò)各種方式來(lái)修復(fù)基因的突變和損傷,已有的研究發(fā)現(xiàn),很多基因突變都和各種發(fā)育缺陷、癌癥等多種疾病相關(guān)。對(duì)于有性生殖的生物來(lái)說(shuō),通過(guò)基因重組來(lái)擴(kuò)大后代的基因多樣性,雖然緩慢,但是一種穩(wěn)定且有效的方式。在這個(gè)過(guò)程中,一個(gè)常見(jiàn)的疑問(wèn)是,為什么兩個(gè)同源染色體之間能精準(zhǔn)地交換同等大小的片段呢?

可以想象,如果交換的基因片段不相等,就會(huì)導(dǎo)致一場(chǎng)災(zāi)難。一個(gè)比較常見(jiàn)的例子,就是染色體易位(非同源染色體的片段重新排列組合,交換后會(huì)使染色體的長(zhǎng)度發(fā)生改變),這個(gè)過(guò)程可能導(dǎo)致胎兒的染色體丟失,甚至導(dǎo)致流產(chǎn)等多種異常情況。由于參與有性生殖過(guò)程的基因在生物體內(nèi)就有保守性,一些科學(xué)家嘗試通過(guò)研究一些較為簡(jiǎn)單的生物,來(lái)解答這個(gè)問(wèn)題,以推進(jìn)對(duì)多種生物的演化、發(fā)育的認(rèn)識(shí)。而這次給出這個(gè)答案的,就是一種采取有性生殖的植物。

一種特別的植物

擬南芥(Arabidopsis thaliana)是一種體型十分嬌小的植物,其基因組較小,只有5對(duì)染色體,是一種典型的自交植物(采取有性生殖)。和它的“前輩”——孟德?tīng)栍糜诎l(fā)現(xiàn)遺傳學(xué)規(guī)律的豌豆一樣——這種植物注定要改變?nèi)藗儗?duì)植物生物學(xué)和遺傳學(xué)的認(rèn)識(shí)。

擬南芥的生長(zhǎng)過(guò)程(圖片來(lái)源:https://elifesciences.org/articles/06100)

2012年,法國(guó)讓-皮埃爾·布爾然(Jean-Pierre Bourgin)研究所的科學(xué)家在此前研究的基礎(chǔ)上,發(fā)現(xiàn)了一種新的蛋白HEI10(一種泛素連接酶),它屬于一類被稱為ZMM的蛋白。后者在減數(shù)分裂中主要負(fù)責(zé)調(diào)控同源染色體上的基因片段交換。此前的研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn)這類蛋白中的多種蛋白各有分工:一些蛋白負(fù)責(zé)將兩條染色體拉近,維持穩(wěn)定的結(jié)構(gòu),另一些促進(jìn)DNA的重組。

有一種猜想認(rèn)為,HEI10蛋白的功能會(huì)有所不同。它在染色體上的數(shù)量,能影響染色體進(jìn)行重組的次數(shù),或能控制染色體發(fā)生重組的位點(diǎn)。近期,在一篇發(fā)表于《自然·通訊》的文章中,來(lái)自劍橋大學(xué)的研究人員為了驗(yàn)證這一猜想,通過(guò)超高分辨率的顯微鏡和數(shù)學(xué)模型,研究了擬南芥在減數(shù)分裂時(shí)期,其染色體上HEI10蛋白的行為。

在染色體重組過(guò)程中,HEI10蛋白的移動(dòng)情況,從最開(kāi)始的數(shù)百個(gè)小的聚集體,最終只富集在幾個(gè)位點(diǎn)。(圖片來(lái)源于論文)

他們發(fā)現(xiàn),在最開(kāi)始時(shí),HEI10蛋白會(huì)把染色體當(dāng)成一條軌道,在上面隨機(jī)移動(dòng),形成很多小的蛋白聚集體。隨著時(shí)間流逝,HEI10蛋白移動(dòng)到同源染色體形成聯(lián)會(huì)復(fù)合體的位點(diǎn)。這一結(jié)構(gòu)形成后,染色體之間才會(huì)進(jìn)行交換。HEI10蛋白移動(dòng)到這個(gè)位置會(huì)被固定住,隨后,越來(lái)越多的HEI10蛋白會(huì)在同一個(gè)地點(diǎn)富集。最終,開(kāi)始由HEI10蛋白組成的數(shù)百個(gè)小聚集體,變成了個(gè)位數(shù)的大聚集體。而在這幾個(gè)HEI10蛋白最為富集的位點(diǎn),染色體會(huì)發(fā)生交叉、重組的現(xiàn)象。

當(dāng)增加植物體內(nèi)HEI10蛋白的表達(dá)時(shí),細(xì)胞內(nèi)發(fā)生染色體重組的位點(diǎn)會(huì)增加,而重組位點(diǎn)之間的距離會(huì)更近。而將細(xì)胞中的HEI10蛋白的數(shù)量降低40%時(shí),同源染色體只有一個(gè)聯(lián)會(huì)復(fù)合體區(qū)域會(huì)發(fā)生基因重組。研究人員認(rèn)為,細(xì)胞的聯(lián)會(huì)復(fù)合體區(qū)域是染色體進(jìn)行交換的候選位點(diǎn),而HEI10蛋白在位點(diǎn)上累積的數(shù)量,才會(huì)決定基因重組是否發(fā)生。

在多種生物中存在

這種基因重組的模式在很多生物體內(nèi)(包括酵母菌、線蟲(chóng)、果蠅和哺乳動(dòng)物)都是保守的。此前,在一篇發(fā)表于《自然·遺傳學(xué)》的研究中,霍華德·休斯醫(yī)學(xué)研究所的尼爾·亨特(Neil Hunter)教授等人發(fā)現(xiàn)當(dāng)缺乏HEI10蛋白,小鼠體內(nèi)染色體重組的前期過(guò)程能順利進(jìn)行,但最終不會(huì)出現(xiàn)染色體重組,也就是說(shuō),HEI10蛋白在這一過(guò)程的后期具有決定性的作用。

這些生命都來(lái)自一個(gè)受精卵,而最初的這個(gè)細(xì)胞中的基因組,也決定了后面組成生物個(gè)體的每一個(gè)細(xì)胞中的基因組組成。無(wú)論是基因上堿基突變的修復(fù)、表達(dá)以及基因重組都需要經(jīng)過(guò)精密的調(diào)控,才能使生命得以存在、延續(xù)。但是,基因也十分脆弱,很多環(huán)境因素不僅能影響親代的基因、患病情況和壽命,還能通過(guò)基因的傳遞,來(lái)影響子代。

也就是說(shuō),一些不良的生活環(huán)境(空氣污染物、紫外線、重金屬和壓力等)和生活習(xí)慣(酗酒、吸煙和食用大量垃圾食品),不僅在影響我們?nèi)祟愖陨淼慕】?,可能正在改變我們最底層的基因。隨著未來(lái)生物技術(shù)的發(fā)展,一部分的有害影響或許可以被消除。但現(xiàn)今,我們每一個(gè)人得以擁有健康的身體,或許還得感謝家族譜系上的親人,以及體內(nèi)時(shí)刻都在認(rèn)真工作的各種細(xì)胞和分子。


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